Mas para testar com a nova versão realize a instalação completa, tem diversos arquivos que acompanham a instalação e precisam ser atualizados... Os Schemas atualizados ficam sempre no diretório Raiz do ACBrMonitor, se utilizar outro diretório conforme aponta sua imagem, precisa atualizar os Schemas nesse diretório.
Outro detalhe pela sua imagem, está setado para versão 1.00 do MDFe, precisa utilizar a 3.00.
O que eu recomendo se estiver fazendo a homologação com a nova versão é realizar uma nova instalação em outro diretório, e refazer as configurações. A versão que utiliza antes está bem defasada...