Bom dia Fabio,
O componente se utiliza do schema cte_v1.04 para validar o xml, o problema é que, os modais possuem um schema separado um para cada modal, no caso do rodoviário temos o cteModalRodoviario_v1.04
Realizei os seguintes testes:
Somente o schema cte_v1.04 => checa o xml menos as tags referente ao modal.
Somente o schema cteModalRodoviario_v1.04 => checa as tags referente ao modal mas não encontra a tag CTe acusando erro de validação.
Usando os schemas cte_v1.04 e cteModalRodoviario_v1.04 (nesta ordem) => checa as tags referente ao modal mas não encontra a tag CTe acusando erro de validação.
Usando os schemas cteModalRodoviario_v1.04 e cte_v1.04 (nesta ordem) => checa o xml menos as tags referente ao modal.
Cheguei a conclusão que podemos adcionar mais de um schema mas somente o utimo é utilizado para validação.
Como não domino esse assunto, e os comandos utilizados para validação, talvez os colegas com mais conhecimentos possam nos ajudar.