Boa tarde Maicon
Eu fiz desta forma por mais de 1 ano e não tive problemas, exceto em um periodo que houve um bug na receita impossibilitando o cadastro mas foi corrigido posteriormente.
Esse metodo é sim uma forma de "burlar" o sistema, mas para nós desenvolvedores autônomos que não tem interesse de ter uma grande expansão de vendas não vejo problemas.
Acredito que a receita federal também saiba desse tipo de uso e para eles o importante é alguém pagando o imposto, não importa quem rs.
O unico problema que vejo é que o cliente é responsável tanto pelo software, quanto como contribuinte, então se houver alguma falha de software na geração dos arquivos fiscais passível de multa ou advertência quem vai responder é o cliente cadastrado com Software House, nunca vi nenhum caso mas acredito que sejam essas as responsabilidades.
Att;