Ai sim, a tua questão até então não apresentava essa preocupação.
Quanto aos registros que devem ser gerados, para o sintegra todos os registros referentes a cupom fiscal, nota de consumidor e nota de saida (NF-e), SPED a mesma coisa mais os complementos.
Veja os seguintes tópicos, para ter uma noção:
viewtopic.php?f=20&t=3238
viewtopic.php?f=12&t=66&p=277
O ideal e trocar uma ideia com os homologadores também, eles geralmente tem documentação para te ajudar nisso.
Quanto a paranoia, fique calmo, leia a ER, entenda ela, repasse todos os itens que você for homologar e depois rode o roteiro umas duas vezes, se você conseguir rodá-lo sem problemas e falhas, não tem erro, vai ser tranquilo a sua homologação.
Para qualquer outra dúvida, se achar necessário contrate uma consultoria.