1. A alíquota e passado no comando VendeItem, F1 = F = Subst.Tributaria, N1=N=Não Tributado, I1=I=Isento ou alíquotas tributadas 700T, 1200T, 1800T, etc, etc. A forma como aparece no cupom fiscal e a impressora quem diz, não o ACBr, verifique se está enviando ao comando a aliquota correta, como é impresso ai e por conta da impressora.
2. Paf 2012, seu contador deve estar dizendo que você precisa estar homologado na última E.R. que no caso e a 01.11, mas se você já é homologado e não venceu ainda o período de 1 ano isso não é necessário, pois você ainda estaria dentro da validade do laudo emitido pela homologadora, agora se seu laudo tem mais de 1 ano, ai sim você precisa reomologar.