Realmente no XML(em anexo) de consulta de situação realmente não consta nenhuma assinatura.
numero do protocolo que estou consultando no portal.
638338303572789658-con-sit.xml
638338303572789658-sit.xml
638338303572789658-con-sit-soap.xml
Caso solucionado, creio que com os dados fornecido ao suporte e varias vezes questionando que o erro era somente na consulta devem ter encontraram a falha no lado deles, e misteriosamente o certificado digital que estou utilizando foi desvinculado do portal e quando fui logar pediu para vincular novamente, após fazer isso consegui consultar os protocolos normalmente e retornando os xml.
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