Olá,
Acho que esses códigos não estavam faltando. Eles não são possíveis para os documentos que são apresentados no Registro D100. Inclusive note no próprio Guia Prático mencionado, na página seguinte:
Isso acontece provavelmente pois documento denegado ou inutilizado não "dê direito à apuração de crédito à pessoa jurídica contratante, na forma da legislação tributária", o que é um requisito para apresentá-lo no D100. Pois para "cada documento informado e relacionado em cada registro D100, obrigatoriamente deve ser apresentado o detalhamento das informações, por item do documento, referentes ao PIS/Pasep (D101) e à Cofins (D105)." (Guia Prático versão 1.0.7 página 135 Parágrafo 4)