Boa tarde.
Conforme foi observado em posts anteriores, o segundo registro de cada boleto, o qual inicia-se por "2", é um registro opcional que consta no layout do próprio banco para informar as mensagens do mesmo.
Para poder auxiliá-lo recomendo que tente extrair do banco qual linha do arquivo possui os registros duplicados, uma vez que o registro do tipo 1 contém os detalhes gerais do boleto e o tipo 2 as mensagens a serem impressas.
Para mais detalhes observe os manuais disponibilizados no svn svn.code.sf.net/p/acbr/code/tools/Bancos/Bradesco
Lay-out do Arquivo-Remessa - Registro de Transação - Tipo 1 (página 11)
Lay-out do Arquivo-Remessa - Registro de Transação-Tipo 2 (página 13)
Att.