Boa tarde Renato,
Primeiramente obrigado pelo feedback e pela atenção.
Não me parece que o problema seja a ausência de TAGS, entre as duas versões. É bem verdade que na versão dois foram geradas novas TAGS como a <soapenv:Header/>, mas não acredito que esse seja o causador do problema.
O que verifiquei, entre as duas estruturas, é que o padrão do envelope SOAP está diferente, como por exemplo o prefixo nfse e sis em diversas TAGS, além da referência de explicitação de xmls em algumas.
Estou encaminhando em anexo os prints com os comparativos realizados, entre os XML SOAP de envio, produzido com as duas versões (1 e 2) do componente. Lembrando que o XML a esquerda (versão 1 do componente) está sendo recebido pelo provedor/cidade em ambiente de homologação sem nenhum problema/rejeição.
Desde já obrigado.