Boa tarde @Benjamin Machado,
Normalmente os arquivos de remessa CNAB não tem nenhuma informação sobre tipo/ambiente se é homologação ou produção no conteúdo do arquivo. O arquivo normalmente é o mesmo.
O que muda no caso da homologação é como você vai transmitir esse arquivo para o banco, podendo ser pelo site/plataforma do banco, onde é selecionado o ambiente de homologação, ou até mesmo enviado por email para o setor responsável do banco ou gerente da conta, dependendo do tipo de relacionamento.
Quando você iniciou o processo de homologação da conta do seu cliente deve ter recebido alguma instrução ou orientação de como deveria ser feito esse trâmite.