Boa tarde!
Como sugestão faça um download pelo site do portal nacional (usando o certificado), porque o XML que vc tem está exatamente como a informação diz.
Pode abrir ele e vc verá que o <DigestValue> do XML não confere com o <digVal> do protocolo de autorização.
Provavelmente vc teve um problema ao enviar e o XML foi enviado. Depois fez uma tentativa de envio novamente (para ter o XML completo), porém a nota estava autorizada e retornou o protocolo de autorização que foi juntando ao XML como o ACBrMonitorPLUS faz. Porém o último XML que vc gerou deve ter alguma coisa diferente do que foi, nem que seja um espaço, mas que não é o mesmo, isto não é.
Abra o que vc tem e verifique <DigestValue> e no protocolo de autorização procure por <digVal> se não são iguais, é como o BigWings comentou, dependendo para quem você envia, poderá não aceitar por não ser um XML juridicamente válido.